Você deve certificar-se que a regras do port faz exatamente o que você quer que ele faça, incluindo empacotamento do port. Estes são os pontos importantes que você precisa verificar.
pkg-plist não contém nada instalado pelo seu port
pkg-plist contém tudo o que está instalado pelo seu port
Seu port pode ser instalado multiplas vezes usando o reinstall target
Seu port cleans up depois ele mesmo desinstala
Ordem de teste recomendada
make install
make package
make deinstall
pkg_add package-name
make deinstall
make reinstall
make package
Certifique-se que não ha quetões avisos em nenhum dos estágios package e deinstall. Depois do passo 3, verifique para ver se todos os novos diretórios estão corretamente apagados. Também, tente usando o software depois do passo 4, para assegurar que está funciona corretamente quando instalado de um pacote.